Este edificio es conocido también por su relevancia dentro de la pintura mural, pues se considera que en sus paredes comenzó el movimiento del muralismo mexicano. Se plasman en él pinturas de Diego Rivera, David Alfaro Siqueiros y José Clemente Orozco, entre otros. Durante más de seis décadas continuó siendo la cuna de varias generaciones de intelectuales y destacadas personalidades. En 1978 el edificio dejó de ser plantel Núm. 1 de la ENP. El edifico permaneció cerrado al público hasta 1992, en que fue restaurado para abrir sus puertas al público como su nombre actual, con el objetivo de ser sede de exposiciones temporales de relevancia mostrando y difundiendo así el acervo arqueológico, histórico y artístico de México y otras culturas.
Como parte de la labor educativa de los jesuitas en la Nueva España, nace en 1583 el Colegio de San Ildefonso. El edificio como lo conocemos hoy en día, surgió a partir de una remodelación durante la primera mitad del siglo XVIII. Actualmente administrado por la UNAM, CONACULTA y el Gobierno de la CDMX, se presentan exposiciones de forma constante y se realizan actividades complementarias a esas exposiciones.
En los muros de San Ildefonso se encuentra plasmada la obra de importantes artistas.
El fin de los conflictos armados de la Revolución dio lugar al inicio de nuevos proyectos.
